Epigrafía romana de la ciudad de León, con un prólogo y una noticia sobre las antigüedades de La Milla del Río por D. Eduardo Saavedra, León, 1866

Reciente hallazgo del primitivo sepulcro de San Alvito, obispo de León, León, 1866 (ed. previa en el diario El Fomento en 1866 y posterior en F. Fita y A. Fernández-Guerra, Recuerdos de un viaje [...], Apéndice XII, 148-150)

Tablettes historiques de la Haute- Loire, Vals, 1870

El Papa Honorio I y San Braulio de Zaragoza, Madrid, 1870

Regia alcurnia de San José, Madrid, 1870

La Santa Cueva de Manresa

reseña histórica, Manresa, 1872

Los Reys de Aragó y la Seu de Girona desde l’any 1462 fins al 1482, Barcelona, 1873

Apuntes para formar una biblioteca hispano- americana del Sagrado Corazón de Jesús, Barcelona, 1874

Cartas de San Ignacio de Loyola, fundador de la Compañía de Jesús, Madrid, 1874-1890

Panegírico de la Inmaculada Concepción, celebrado por la Iglesia española a fines del siglo IV. Discurso panegírico pronunciado en la Catedral-Basílica de Barcelona el día 8 de diciembre de 1874, Barcelona, 1875 (reed. en Tres discursos históricos, Madrid, 1909)

Sermón de la Bula de la Santa Cruzada, Madrid, 1877

Restos de la declinación céltica y celtibérica en algunas lápidas españolas, Madrid, 1878

con E. Saavedra, El Gerundense y la España primitiva. Discursos leídos ante la Real Academia de la Historia en la recepción pública del R.P. Fidel Fita y Colomé, de la Compañía de Jesús, el día 6 de julio de 1879. Contestación de Eduardo Saavedra, Madrid, 1879

con A. Fernández-Guerra, Recuerdos de un viaje a Santiago de Galicia, Madrid, 1880 (La Coruña, 1993)

Lo Llivre vert de Manresa, Manresa, 1880

Galería de Jesuitas ilustres, Madrid, 1880

Suplementos al Concilio nacional Toledano VI, Madrid, 1881

Actas inéditas de los siete concilios españoles celebrados desde el año 1282 hasta el 1314, Madrid, 1882

Le Codex de Saint-Jacques de Compostelle, Paris, 1882

Epigrafía romana. Colección de artículos escritos y publicados por el R. P. Fita en el Boletín de la Real Academia de la Historia, Madrid, 1883

con A. López Ferreiro, Monumentos antiguos de la iglesia Compostelana. Artículos escritos y publicados por el muy ilustre señor doctor D. Antonio López Ferreiro y el R.P. Fidel Fita, Madrid, 1883

Estudios históricos. Colección de artículos escritos y publicados por el R.P. Fidel Fita en el Boletín de la Real Academia de la Historia, Madrid, 1884-1887, 8 vols.

Fray Bernal Buyl o el primer apóstol del Nuevo mundo. Colección de documentos raros e inéditos relativos a este varón ilustre, Madrid, 1884

La Santa Biblia

Vulgata latina y su traducción al español por Felix Torres Amat, con notas de éste y del P. Felipe Scio de San Miguel

cronologías, comentarios y vindicias del P. Fidel Fita, Barcelona, 1885-1886

con F. de Cárdenas, Legis romanae Wisigothorum fragmenta ex codice Palimpsesto, Madrid, 1886 ( = Código de Alarico II. Fragmentos de las lex romana de los visigodos conservados en un códice palimpsesto de la Catedral de León. Prólogo de F. de Cárdenas y F. Fita, Madrid, 1991)

La España hebrea. Datos históricos por el R. P. Fidel Fita, individuo de número de la Real Academia de la Historia, Madrid, 1888-1889

Bosquejo de la exposición histórico-europea, en el día de su apertura, Madrid, 1892

con B. Oliver y V. Vignau, Cortes de los antiguos reinos de Aragón, Valencia y Principado de Cataluña. Cortes de Cataluña, 24 vols. (con B. Oliver en vols. 1-13

con B. Oliver y V. Vignau en vol. 16

con V. Vignau en vols. 17-22), Madrid, 1897 ss.

con M. C. Solano Gálvez de San Pelayo, marqués de Monsalud, Arqueología romana y visigótica de Extremadura. Discursos leídos ante la Real Academia de la Historia en la recepción pública del Excmo. Sr. D. Mariano [...] el día 3 de junio de 1900. Contestación de Fidel Fita, Madrid, 1900

con G. Llabrés, Privilegios de los hebreos mayorquines en el Códice Pueyo, Madrid, 1900

Cartas edificantes de los misioneros de la Compañía de Jesús en Filipinas 1898- 1902, Barcelona, 1903

Elogio de León XIII, Madrid, 1903 (reed. en Tres discursos históricos, Madrid, 1909)

Catecismo Breve. Primera parte del Compendio de doctrina cristiana para las clases inferiores, Madrid, 1906

con J. R. Mélida, Iberia arqueológica ante-rromana. Discursos leídos ante la Real Academia de la Historia en la recepción pública del Ilmo. Sr. D. José Ramón Mélida el día 8 de diciembre de 1906. Contestación del R. P. Fidel Fita, Madrid, 1906

Elogio de la reina de Castilla y esposa de Alfonso VIII, Doña Leonor de Inglaterra, Madrid, 1908 (reed. en Tres discursos históricos, Madrid, 1909)

Tres discursos históricos: Panegírico de la Inmaculada Concepción, celebrado por la Iglesia española a fines del siglo IV. Elogio de León XIII. Elogio de la reina de Castilla y esposa de Alfonso VIII, Doña Leonor de Inglaterra, Madrid, 1909

con J. López de Ayala, conde de Cedillo, Jovellanos en la Real Academia de la Historia. Número extraordinario del Boletín de la Real Academia de la Historia, Madrid, 1911

con A. Fernández Casanova, La catedral de Ávila. Discurso leído por A. Fernández Casanova en el acto de su recepción pública y contestación de D. Fidel Fita Colomé, el día 24 de mayo de 1914, Madrid, 1914

Autógrafos epistolares inéditos de Santa Teresa de Jesús, Madrid, 1916

Fraga: huellas ibéricas y romanas, Barcelona, 1991 (col. de artículos).

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Juan Manuel Abascal Palazón