Hijo de Rosalía Gómez Gaona y de Ignacio Obregón, que era hijo ilegítimo de Antonio Obregón y Alcocer, conde de La Valenciana. Por su origen, pertenecía a una importante y rica familia, por lo que, hasta cierto punto, se le puede considerar como un representante de la oligarquía propietaria de minas, siéndolo en España del Tribunal de la Minería de México. Estaba su familia muy próxima al virrey Iturrigaray, y, al ser éste derrocado, Octaviano y su hermano Ventura emigraron a España.

Académicamente, Octaviano realizó estudios de Latín, Retórica y tres años de Filosofía en el Seminario de Guadalajara, graduándose, en 1799, como bachiller en Artes. Siguió sus estudios en la Real y Pontificia Universidad de México, titulándose como bachiller en Cánones, en 1803, y en Leyes, en 1804. En 1807 ingresó en el Ilustre y Real Colegio de Abogados de México. Viviendo ya en la Península, fue nombrado, el 8 de marzo de 1810, oidor honorario de esa misma Audiencia, ascendiendo, ocho días más tarde, a oidor supernumerario. [...]