Hijo del guipuzcoano Pedro José Estomba y de Pascuala Tadea Mitre, de origen uruguayo y tía de los generales Bartolomé y Emilio Mitre.

Desde el 6 de julio de 1810 integró el Regimiento n.º 6 de Infantería de Buenos Aires, luego prestó sus servicios en el interior del país como parte del Ejército Auxiliar presenciando, en Córdoba, el levantamiento contrarrevolucionario liderado por Santiago de Liniers. Entre 1810 y 1811 intervino en las batallas de Cotagaita, Suipacha y Huaqui mientras que, con el grado de capitán del Regimiento de Dragones del Alto Perú, entre 1812 y 1813 participó, bajo las órdenes del general Manuel Belgrano, de los combates de Las Piedras, Tucumán, Salta, Vilcapugio y Ayohuma. [...]