Los datos personales que se conocen de Melchor de Aguirre son muy escasos. Se ignoran la fecha y el lugar de su nacimiento. Las opiniones que existen son contradictorias; para René Taylor era de origen vasco y había nacido en San Sebastián hacia 1630, mientras que Valverde Madrid considera que debió nacer en Cabra (Córdoba) por el año de 1640.

Las primeras noticias seguras que sobre el maestro hay derivan de su participación en la ejecución del retablo mayor de la parroquial de Cabra, obra que realizaría siguiendo la traza dada por José Granados en 1673. A partir de esta fecha Melchor de Aguirre está ligado a las obras que se realizan en la iglesia de Nuestra Señora de la Asunción y Ángeles de Cabra, participando junto con Baltasar Pérez Capote, en 1684, en la consolidación de la parroquia que se había resentido. Con anterioridad a estas fechas, en 1675, en marzo, se trasladó a Málaga para realizar los púlpitos de la catedral de Málaga. Algunos años después, en 1679, Aguirre debió de trasladarse a Córdoba, donde había contratado la ejecución de la capilla y retablo de la Purísima Concepción en la catedral. Mientras trabajaba en esta capilla debió de realizar la portada de la Virgen de la Fuensanta. [...]