Francisco Hurtado de Mendoza y Fajardo era hijo de Juan Hurtado de Mendoza, llamado el Santo, III conde de Monteagudo y VII señor de Almazán, y de Luisa Fajardo. Su padre era, a su vez, nieto por vía materna del Gran Tendilla, Íñigo López de Mendoza y Quiñones, II conde de Tendilla, y descendía directamente de Juan Hurtado de Mendoza el Limpio, I señor de la villa soriana de Almazán.

Francisco Hurtado de Mendoza ingresó como caballero de la Orden Militar de Santiago en 1561, siendo ya IV conde de Monteagudo. Casó con María de Cárdenas y Tovar, hija del II duque de Maqueda, Bernardino de Cárdenas, y de Isabel de Velasco, de la casa de los condestables de Castilla. De su matrimonio nacieron, al menos, siete hijos: Francisco Hurtado de Mendoza y Cárdenas, que sería II marqués de Almazán y V conde de Monteagudo, virrey y capitán general de Cataluña, casado con Ana Portocarrero; Luisa Fajardo y Mendoza, esposa de Juan Antonio Portocarrero; Isabel de Velasco y Mendoza, casada con Luis Carrillo de Toledo, I marqués de Caracena; María de Cárdenas y Mendoza, marquesa de la Guardia por su matrimonio con Gonzalo Mexía; y Francisca de Mendoza. Fue su sobrina, hija de su hermana María de Mendoza y Pacheco y de Francisco de Carvajal y Vargas, la venerable Luisa de Carvajal y Mendoza. Precisamente esta dama, entregada desde muy joven a su vocación religiosa y misional, dejó una breve descripción física de su tío, a quien definía como “no muy alto ni pequeño, blanquísimo, y el cabello como un mismo oro, algo ensortijado […] ojos […] realísimos y demostradores de su ánimo”. [...]