Nació en una familia emeritense de los llamados “cristianos viejos” y fue bautizado en la iglesia de Santa Eulalia el 31 de octubre de 1638. Eran sus padres Juan López Valladolid y Juana de Orea, labradores empobrecidos por la guerra hispano-portuguesa de 1640-1668. Reinaba en España Felipe IV y los soldados arrasaban los campos y sembraban el pánico en las ciudades fronterizas con violencias de guerra. En este clima creció Cristóbal Fernández Valladolid.

En su vida se distinguen tres etapas: la emeritense, que le aporta los materiales con los que va forjando su personalidad como sacerdote, eremita, fundador hospitalario y cofrade. Tras los estudios primarios, combina desde los catorce años el estudio de Gramática y Latinidad con el trabajo familiar, el servicio voluntario de enfermero en el Hospital de San Juan de Dios y su actividad como sacristán en el convento de las franciscanas concepcionistas. Son experiencias clave para que Francisco de Asís y Juan de Dios le marquen en su vida espiritual y hospitalaria. Termina los estudios y fray Juan de Chaves le ofrece un puesto de trabajo en el hospital. Después le ayudará a seguir su vocación sacerdotal. En 1661 solicita en san Marcos de León ser recibido a la prima clerical, tonsura y órdenes menores y, tras completar los estudios exigidos por el concilio de Trento y cumplir los demás requisitos, marcha a Badajoz para ser ordenado por su obispo fray Jerónimo Rodríguez Valderas, el 10 de marzo de 1662. Vuelto a Mérida ejerce su servicio sacerdotal en el Hospital de San Juan de Dios y en la institución del cabildo de clérigos de San Pedro. En 1665 es destinado como ayudante de capellán castrense al Tercio de Castilla, que lidera el marqués de Caracena. El 17 de junio de 1665 se libra la batalla definitiva para la independencia de Portugal; los españoles son vencidos en Montes Claros y en la retirada caen prisioneros o en emboscadas. Cristóbal queda solo y gravemente enfermo en un descampado. [...]