Nació en 1880 durante las vacaciones estivales en San Sebastián, de Manuel Mariátegui y Vinyals, VII conde de San Bernardo, y de María del Rosario Pérez de Barradas y Fernández de Córdoba, duquesa de Monteleón de Castilblanco (desde 1893 con carácter vitalicio) y XIII marquesa de Peñaflor (Écija, Sevilla, 30 de agosto de 1855-San Sebastián, Guipúzcoa, 1 de diciembre de 1943), ambos Grandes de España, siendo el tercer hijo varón de este matrimonio.

Alfonso Mariátegui casó el 25 de junio de 1915 con María Araceli de Silva y Fernández de Córdoba, XI duquesa de Almazán, merced que había sido usada por los primogénitos de la Casa de Aranda y que rehabilitó el 24 de marzo de 1915 su padre, Alfonso de Silva Fernández de Híjar y Campbell, XV duque de Híjar —casado con María del Dulce Nombre Fernández de Córdoba y Pérez de Barradas, perteneciente a la Casa de Medinaceli—, precisamente para su hija, a quien se lo cedió apenas dos semanas más tarde, el 9 de abril de 1915, y con ocasión de su matrimonio con Mariátegui, que comenzó a usarlo iure uxoris. De este matrimonio nacieron cuatro hijos, entre los que sobrevivió sólo la mujer: María del Rosario Mariátegui y Silva, que sucedió en las mercedes de sus progenitores. [...]