Se carece de información sobre la ascendencia e infancia de Juan Díaz, pero es posible que estuviera emparentado con los hermanos Alfonso y Juan de Valdés. Estudió en Alcalá de Henares hasta aproximadamente 1530 y de allí —quizá huyendo ante el escándalo motivado por la publicación del Diálogo de doctrina christiana de Juan de Valdés— pasó a París, donde vivió hasta 1545. En esa Universidad obtuvo en 1536 su bachillerato en Artes y, al menos entre 1541 y 1544, fue alumno del Colegio Real recién fundado, donde asistió a las clases de hebreo de Francisco Vatablo. Fue durante su larga estancia en París cuando Díaz se apartó de la doctrina católica hacia posturas heterodoxas, entrando en contacto con grupos protestantes de la ciudad, si bien este cambio se atribuye en fuentes contemporáneas a la acción de Diego de Enzinas. Ante la presión cada vez más intensa a que se veían sometidos allí los heterodoxos, en marzo de 1545 Díaz huyó en compañía de Claude de Senarclens a Ginebra, donde durante meses trató con reformadores como Calvino o Farel. En otoño siguió viaje a Estrasburgo, donde fue acogido por Bucero y se incorporó a la Corte en el exilio de Jacques de Bourgogne, señor de Falais. Estableció relaciones con las figuras más destacadas del floreciente Gymnasium de la ciudad, Sturm y Fagius. Simultáneamente actuaba para el cardenal Jean Du Bellay como informador sobre la situación religiosa en Alemania. [...]