Fue hijo primogénito de Juan Fernández de Híjar y Cabrera, y de Catalina de Beaumont de Navarra y Curtón. Hermano de Jaime (fallecido en 1488); Margarita, mujer de Felipe de Erill; Timbor, casada con Felipe Galcerán de Castro, señor de Estadilla, Castro y Pinós; Blanca que enlazo con Blasco de Alagón, señor de Sástago y Pina; y Catalina, que contrajo matrimonio con Lope Ximénez de Urrea —I conde de Aranda, desde el 9 de enero de 1488, por servicios prestados a Fernando el Católico—, fue la única que tuvo sucesión. Fue además II duque de Aliaga, VII barón y I conde de Belchite.

Luis casó con Guiomar Enríquez de Mendoza (fallecida en Belchite, el 13 de mayo de 1519), quien llevó una buena dote al matrimonio. Guiomar era hija de Juan Enríquez, I conde de Alba de Aliste, y María de Guzmán el Bueno, por lo que los Fernández de Híjar enlazaron con la Monarquía, puesto que Juana Enríquez (reina de Navarra, fallecida en 1468) y Guiomar eran de la misma familia. Tuvieron tres hijos: Luis, que murió muy joven; Juan —que usó, como primogénito que era, el título de conde de Belchite y casó con Isabel de Espes y Fabra—, y Guiomar, que contrajo matrimonio con su tío Paulo de Alagón, de la casa de Sástago y Pina, y no tuvo descendencia. [...]