Fue bautizada con los nombres de María de las Mercedes Teresa María de la Paz Fernanda Adalberta Cristina Antonia Isidora Raimunda Josefa Jesusa Fausta de Todos los Santos Francisca de Borja, si bien era conocida como infanta Mercedes y celebraba su onomástica el 24 de septiembre. Era hija de Fernando María de Baviera, infante de España, y de su primera esposa, la infanta María Teresa. El rey Alfonso XIII, su tío, estableció antes de su nacimiento (29 de septiembre de 1911): “[...] vengo en disponer que el Príncipe ó Princesa que diere á luz mi dicha hermana [la infanta doña María Teresa] en su próximo parto, goce las prerrogativas de Infante de España y mando que se le guarden las preeminencias, honores y demás distinciones correspondientes á tan alta jerarquía”.

Fue dama de la Orden de Damas Nobles de María Luisa, dama protectora honoraria del Real Cuerpo de Hijosdalgo de la Nobleza de Madrid, dama de las reales maestranzas de Sevilla y de Zaragoza y dama de honor y devoción de la Soberana Orden Militar de Malta. Durante la Guerra Civil Española fue enfermera de la Cruz Roja Española y dama auxiliar de Sanidad Militar de primera clase; fue condecorada con las Medallas de Sanidad Militar, de plata de campaña, de Cruz Roja, de oro de la Cruz Roja, Placa de segunda clase de la Cruz Roja y de campaña con distintivo de retaguardia. [...]