Hijo de Francisco Chaperón, teniente coronel del Regimiento de Dragones de Sagunto, y de María Antonia Labarca, azafata de la infanta María Isabel. Ingresó en el Ejército, en la clase de Cadete de Dragones de Sagunto, el 3 de diciembre de 1777. Ya con el empleo de capitán, contrajo matrimonio en el Real Sitio de Aranjuez, el día 4 de febrero de 1792, con Juana Cortés Solís, camarista de la infanta María Amalia.

Chaperón Labarca participó en el sitio y toma de la plaza de Mahón y, embarcado en los flotantes, en el bloqueo del Campo de Gibraltar. En la guerra de Francia de 1793, como capitán de los batallones de Guipúzcoa y Álava del ejército de Navarra, se halló en todas las acciones en que intervino este ejército hasta el año 1795. [...]