Después de la trágica desaparición de su hermano Felipe, Pedro heredó la mariscalía de Navarra (vinculada desde generaciones a su familia) y la jefatura de la facción agramontesa. Constituido en portaestandarte de los monarcas navarros, su norte político fue la sistemática oposición al partido beaumontés, convencido de que era el único medio para eliminar injerencias políticas no deseadas. De ahí que tanto la reina Leonor como el rey Febo y los Albret le beneficiaran largamente: así el 22 de marzo de 1498, y con motivo de su casamiento, una real merced de Juan de Albret dispuso que se le entregaran 3000 escudos de oro así como las alcabalas de San Martín, Murillo el Fruto y Pitillas con la jurisdicción baja y mediana, baylíos y penas foreras de los tres lugares.

Casado con Mayor de la Cueva, hija del duque del Alburquerque, emparentó con los condestables de Castilla, convirtiéndose de esta manera en la persona ideal que podía hacer de puente entre Navarra y Castilla. Por ello, en 1507 recibió una importante merced o acostamiento concedido por Fernando el Católico en gracia, posiblemente, a los servicios de mediación prestados el año anterior cuando en el Tratado de Tudela de Duero se quisieron arreglar las diferencias surgidas con Juana de Castilla. Un acostamiento, también de 100.000 maravedís, volvió a concedérsele en 1508. [...]