Eugenio Aguinaga —su padre era notario y su madre pertenecía a una familia de navieros— realizó sus estudios de arquitectura en la Escuela de Arquitectura de Madrid (1928-1934). Obtuvo el Premio Extraordinario tras presentar un anteproyecto de pabellón para exposiciones de arte. De entre los arquitectos de su promoción también destacaron Fernando Chueca Goitia, Félix Candela y Carlos de Miguel. Aficionado a los deportes, llegó a estar preseleccionado para los juegos olímpicos de Los Ángeles (1932) en la categoría monotipo de vela.

Siendo estudiante en Madrid, se inició en la práctica profesional con el arquitecto Luis Gutiérrez Soto. Recibió, en especial, la influencia de José Manuel Aizpúrua, arquitecto y miembro destacado del Grupo de Artistas y Técnicos Españoles para el Progreso de la Arquitectura Contemporánea, de quien era primo carnal. Colaboró profesionalmente con Aizpúrua en dos concursos de arquitectura y publicó en la revista AC, órgano de ese grupo vanguardista, con el cual, dados sus primeros proyectos, fue relacionado, pero del que guardó una distancia en su trayectoria. [...]