Antes de ser gobernador y capitán general de Venezuela, se sabe que Fernando Rojas desempeñó, desde el 9 de abril de 1682, el cargo de corregidor de la ciudad de Arequipa, en el virreinato del Perú, y que fue prorrogado en su nombramiento el 3 de marzo de 1688. Llevaba, pues, varios años en América cuando fue nombrado gobernador por Real Cédula datada en Madrid el 6 de septiembre de 1704, que comenzaba así: “Don Phelipe, etc. – Por quanto atendiendo a lo que vos don fernando de Rojas y Mendoza Cavallero de la Orden de Calatrava me haveis servido y esperandolo continuareis con la fidelidad que sois obligado he resuelto por mi real decreto de este año haceros merced del Gobierno y la Capitania General de la provincia de Venezuela para que le sirvais por tiempo de cinco años luego que cumpla los cinco años por que esta previsto en el Sargento mayor d. Miguel de Anos y Saraza o llegue a vacar por cualquier accidente siendo como es mi voluntad useis y exerçais este empleo en las ciudades villas y lugares que alpresente estan poblados y adelante se poblaren en la jurisdicción de dicha provincia según y de la manera que lo an hecho y devido hazer vuestros antecesores guardando y cumpliendo lo proveido y que se proveyere para el gobierno de la provincia buen tratamiento de los yndios y administracion de justicia y mando al presidente y los de mi consejo de las yndias tomen y rezivan de vos el referido don fernando de Roxas y Mendoza el juramento acostumbrado con la sollenidad que se requiere...”. [...]