Juan de Zúñiga se pasó la vida intentando asimilar los problemas derivados de su origen ilegítimo. Nació en Madrigal de las Altas Torres, hijo de Diego de Zúñiga, natural de Salamanca, y de Inés de Flores, natural de Madrigal y de quien no se tiene ninguna información. Se educó en Salamanca e inició su carrera profesional en la Inquisición, convirtiéndose en inquisidor de Valencia hacia el año 1579 y de Toledo (1584-1586). Su talento fue reconocido por un observador que escribió de él en 1579 que “tiene suficiencia para qualquiera cosa”, pero su bastardía le impidió conseguir la promoción profesional que él creía merecer y esto le convirtió en una persona de actitud amargada, severa e implacable con el prójimo. En 1586, por ejemplo, Felipe II le propuso para el obispado de Canarias y el conde de Olivares, embajador en Roma, tuvo que realizar un tremendo esfuerzo para obtener la dispensa papal necesaria por ilegitimidad. Sin embargo, el Papa se no se la concedió; Olivares informó que lo único que había conseguido a cambio de las molestias eran sermones, “con que del todo e perdido la esperanza deste negocio”. El Papa también denegó a Zúñiga el cobro de una pensión de la iglesia de Segovia y Zúñiga escribió desconsoladamente “por no estar yo dispensado para pensiones”. [...]