Hija del III duque de Gandía y de su primera esposa Juana de Aragón fue, por tanto, hermana de san Francisco, con quien mantuvo desde la niñez una relación muy estrecha. La fecha de su nacimiento es polémica, pues el padre Nonell atribuía la muerte de su madre precisamente al parto de Luisa el 19 de agosto de 1520; E. García Hernán, en cambio, coincide en el mismo día y mes, pero del año 1512, que parece la datación más probable.

Tras la derrota de las tropas reales ante los agermanados en la batalla del Vernissa (25 de julio de 1521), marchó precipitadamente a Zaragoza con su abuela materna Ana de Gurrea, pero pronto la llevaron a Medina Sidonia, donde vivió en casa de la duquesa Ana, tía materna suya, hasta que se casó en 1541. [...]