Descendiente directo de los Hermanos Pinzón, compañeros de viaje de Colón en su gesta americana, era de familia hidalga por sus cuatro abuelos, como exigía las normas de acceso a la Armada en la época.

Su padre, Luis Hernández Pinzón Prieto, que había nacido en Moguer, alcanzó el empleo de teniente de navío en la Armada, y su madre, María Teresa Álvarez Muñoz, era natural de San Juan del Puerto (Huelva), localidad situada a siete km del propio Moguer y a veinte de la capital provincial. Permaneció en su Moguer natal hasta los diecisiete años, nutriendo su inteligencia y sus sentidos con narraciones y hechos náuticos a los que iban unidos, de una parte sus gustos y aficiones naturales, y de otro el honor de su nombre, famoso en la historia de España desde 1492. Empezó su carrera en el Departamento de Cádiz, donde fue examinado de los estudios elementales y aprobado en grado de suficiente, sentando plaza de guardia marina el 12 de abril de 1833 y embarcando en la barca n.º 8, como dotación, de donde pasó al bergantín Guadalete el 14 de mayo, con el que realizó varias navegaciones de vigilancia de las aguas nacionales hasta el 4 de octubre que dio la vela para Puerto Rico y La Habana. Allí transbordó a la fragata Restauración, en la que permaneció hasta el 1 de marzo de 1834, fecha en que fue destacado en comisión al bergantín goleta Amalia, en el que salió de vigilancia sobre la zona de Mariel (Pinar del Río-Cuba), al norte de la isla, hasta el 30 de marzo en que regresó a La Habana y se reincorporó a su buque la fragata Restauración, donde permaneció hasta su regreso a la Península, para lo cual transbordó al navío Héroe el 10 de julio de 1834. Al llegar a Ferrol el 16 de agosto, transbordó a petición propia al bergantín Manzanares, con el que salió de Ferrol para la costa cantábrica con motivo del inicio de la Primera Guerra Carlista. [...]