Nació en el seno de una familia sin estrecheces económicas a pesar de su amplitud, ya que fue el séptimo hijo de José Mariano Matamoros Galindo y de Ana Josefa Guridi. De origen criollo, obtuvo el grado de bachiller en Artes por la Real y Pontificia Universidad de México en 1786, y tres años más tarde le fue concedido el grado en Teología y concluyó su formación en el seminario conciliar de México, ordenándose sacerdote en marzo de 1796 en la iglesia del convento de Santa Inés de la Ciudad de México.

Comenzó su carrera eclesiástica atendiendo a los curatos alejados de las capitales de provincias; así, su primer destino fue en la iglesia de Santa María de Tepetitlán (en el actual estado de Hidalgo). De ahí pasó a la parroquia de Nuestra Señora de la Asunción en Pachuca, y, ya como vicario, ejerció cuatro años en el pueblo de Concepción de Bucareli. Durante once años ejerció sus obligaciones eclesiásticas en diversos sitios hasta que en 1808, y debido a su delicada salud le llevó a recaer en la parroquia de San Pedro Jantetelco (en el actual estado de Morelos). [...]