Estudios literarios, Madrid, Imprenta de R. Labajos, 1866

Principios elementales de Derecho natural, Madrid, Est. Tipográfico de Tomás Rey, 1871

Lecciones sumarias de Psicología, Madrid, Imprenta de J. Noguera, 1874

con A. Calderón, Prolegómenos del Derecho. Principios de Derecho natural, Madrid, Imprenta de la Biblioteca de Instrucción y Recreo, 1874

Estudios jurídicos y políticos, Madrid, Victoriano Suárez, 1875

Estudios filosóficos y religiosos, Madrid, Librería de Francisco Góngora, 1876

Estudios sobre educación, Madrid, Imprenta de M. Minuesa, 1886

“Paisaje”, en La Ilustración Artística, V (1886), págs. 91-92 y 103-104

con H. Giner de los Ríos, Portugal. Impresiones para servir de guía al viajero, Madrid, Imprenta Popular, 1888

Educación y enseñanza, Ronda, Imprenta de El Tajo, 1889 (Biblioteca Andaluza)

Estudios sobre artes industriales, Madrid, Librería de Jorro, 1892

con A. Calderón, Resumen de Filosofía del Derecho, Madrid, Victoriano Suárez, 1898

La persona social. Estudios y fragmentos, Madrid, Victoriano Suárez, 1899

Filosofía y Sociología. Estudios de exposición y de crítica, Barcelona, Henrich y Compañía, 1904 (Biblioteca Sociológica Internacional)

Pedagogía universitaria. Problemas y noticias, Barcelona, Sucesores de Manuel Soler, 1905 (Manuales Soler, LVIII)

“En el centenario de Sanz del Río”, en Boletín de la Institución Libre de Enseñanza, XXXVIII (1914), págs. 225-231

Ensayos sobre educación, Madrid, La Lectura, 1915

Obras completas, Madrid, La Lectura y Espasa Calpe, 1916-1936, 20 vols. [contiene: vol. I: con A. Calderón, Prolegómenos del Derecho. Principios de Derecho Natural, 1916

vol. II: La Universidad española, 1916

vol. III: Estudios de literatura y arte, 1919

vol. IV: Lecciones sumarias de Psicología, 1920

vol. V: Estudios jurídicos y políticos, 1921

vol. VI: Estudios filosóficos y religiosos, 1922

vol. VII: Estudios sobre educación, 1922

vols. VIII y IX: La persona social. Estudios y fragmentos, 1923-1924

vol. X: Pedagogía universitaria. Problemas y noticias, 1924

vol. XI: Filosofía y Sociología. Estudios de exposición y de crítica, 1925

vol. XII: Educación y enseñanza, 1925

vols. XIII y XIV: con A. Calderón, Resumen de Filosofía del Derecho, 1926

vol. XV: Estudios sobre artes industriales y cartas literarias, 1926

vols. XVI, XVII y XVIII: Ensayos menores sobre educación y enseñanza, 1927

vol. XIX: Informes del Comisario de Educación de los Estados Unidos, 1928

vol. XX: Arqueología artística de la Península, 1936]

Ensayos y cartas (ed. de homenaje en el cincuentenario de su muerte), México D.F., Fondo de Cultura Económica, 1965

Ensayos, selec., ed. y pról. de J. López-Morillas, Madrid, Alianza, 1969

Antología pedagógica, selec. y est. prelim. de F. J. Laporta, Madrid, Santillana, 1977

Escritos sobre la Universidad española, ed. de T. Rodríguez de Lecea, Madrid, Espasa Calpe, 1990

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Isabel Pérez-Villanueva Tovar